Pendakian Gunung Jaya Wijaya membutuhkan persiapan yang matang dan fisik yang kuat, karena medan pendakiannya sangat menantang. Rute pendakian yang paling umum dimulai dari Desa Sugapa atau Tembagapura, yang kemudian dilanjutkan dengan perjalanan melintasi hutan lebat, sungai, dan tebing-tebing curam. Perjalanan ini memakan waktu sekitar satu minggu hingga dua minggu, tergantung pada kondisi cuaca dan kebugaran pendaki. Pendakian ini sering kali dilakukan dengan bantuan pemandu lokal yang berpengalaman.

Keindahan alam di sekitar Gunung Jaya Wijaya sangat mempesona. Di sepanjang perjalanan, pendaki akan disuguhi pemandangan hutan hujan tropis, lembah yang hijau, dan pemandangan pegunungan yang spektakuler. Selain itu, keberadaan gletser di puncak gunung memberikan pengalaman yang unik dan langka bagi para pendaki. Keberadaan gletser ini menjadi salah satu daya tarik utama Gunung Jaya Wijaya, meskipun sayangnya, gletser ini semakin menipis akibat perubahan iklim.

Gunung Jaya Wijaya juga merupakan habitat bagi berbagai jenis flora dan fauna endemik. Hutan di sekitar gunung ini merupakan rumah bagi berbagai spesies tumbuhan langka, seperti anggrek Papua dan berbagai jenis lumut. Selain itu, satwa liar seperti burung cenderawasih, kuskus, dan kanguru pohon dapat ditemukan di kawasan ini. Keanekaragaman hayati yang luar biasa ini menambah daya tarik Gunung Jaya Wijaya sebagai tujuan pendakian dan penelitian.